ردیابی و تکثیر ژن های اثرگذار حامل دومین lysmدر ژنوم قارچ f. oxysporum f. sp. lycopersici

Authors

فرهاد شکوهی فر

farhad shokouhifar research center for plant sciences, ferdowsi university of mashhad, mashhad, iranپژوهشکده علوم گیاهی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد الهه ربیعی مطلق

elahe rabiei-motlagh plant pathology department, college of agriculture, ferdowsi university of mashhad. mashhad, iranگروه گیاه پزشکی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد ناهید عباس پور

nahid abbaspour research center for plant sciences, ferdowsi university of mashhad, mashhad, iranپژوهشکده علوم گیاهی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد صهبا طوسی

sahba toosi research center for plant sciences, ferdowsi university of mashhad, mashhad, iranپژوهشکده علوم گیاهی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد

abstract

قارچ (fol) fusarium oxysporum f. sp. lycopersici در طی کلونیزهکردن آوند گیاه گوجه فرنگی پروتئین های کوچک اثرگذاری را به درون آوند گیاه ترشح می کند که دستگاه مقاومتی گیاه را مهار یا مختل می کند و سبب بروز بیماری می شود. تاکنون 14 پروتئین اثرگذار در این بیمارگر شناسایی شده است که هیچیک دومین مشخصی در توالی پروتئینی خود ندارند. در دیگر قارچ های بیمارگر پروتئین های اثرگذار حامل دومین lysm جهت اتصال به کیتین و تجزیه آن شناسایی شده است. با توجه به کارکرد مهم این دومین در برهمکنش قارچ و گیاه، در مطالعه حاضر جستجو برای شناسایی ژن های اثرگذار حامل دومین lysm در قارچ fol انجام شد. در ابتدا جستجوی دومین lysm در ژنوم fol به کمک پایگاه اطلاعاتی pfam به شناسایی 17 پروتئین منتج شد که در این بین، با توجه به وزن مولکولی پایین پروتئین های اثرگذار و ترشح آنها در فضای بین سلولی، دو پروتئین فرضی به نامهای fol-lysm1 و fol-lysm3 جهت مطالعات تکمیلی انتخاب شدند. پیشبینی ساختار ژنی مفروض با fgenesh+صورت گرفت؛ سپس، حضور ساختارهای دومینی و خصوصیات پروتئینهای افکتوری مانند مناطق سیگنال پپتیدی، تعداد و موقعیت اسیدآمینه سیستیین و باندهای دیسولفیدی و وزن مولکولی در fol-lysm1 و fol-lysm3 پیش بینی شد. در ادامه توالی کدکننده دو پروتئین مزبور در ژنوم folتکثیر و تعیین توالی شد و با بقیه پروتئین های اثرگذار دارای دومین lysm ازنظر فیلوژنتیکی و سازماندهی دومین ها مقایسه شد. این اولین گزارش از ردیابی ژن های اثرگذار دارای دومین lysm در fol است که توالی fol-lysm1 با شماره دستیابی ku522305 در بانک ژن ثبت شد.

Upgrade to premium to download articles

Already have an account?login

similar resources

ردیابی و تکثیر ژن های اثرگذار حامل دومین LysMدر ژنوم قارچ F. oxysporum f. sp. lycopersici

During the infection- while the xylem is colonized by the F. oxysporum f. sp. Lycopersici (Fol)- several effector proteins have been secreted into the xylem that suppress the plant’s defense response and enable parasitic colonization. So far, 14 effector proteins have been reported in Fol. However, there are no identified domains in their sequences. LysM effector proteins were identified ...

full text

3'-Hydroxylation of 4'-methoxyisoflavones by Fusarium oxysporum f. lycopersici.

3'-Hydroxylation of isoflavones by Fusarium oxysporum f. lycopersici mainly proceeds with 4'-methoxy-7-hydroxyderivatives; this reaction is used for quantitative conversion of 14C-labelled isoflavones.

full text

PCR detection of Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici and races of F. oxysporum f. sp. lycopersici of tomato in protected tomato-growing areas of the eastern Mediterranean region of Turkey

* Correspondence: [email protected]

full text

Origin of Race 3 of Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici at a Single Site in California.

ABSTRACT Thirty-nine isolates of Fusarium oxysporum were collected from tomato plants displaying wilt symptoms in a field in California 2 years after F. oxysporum f. sp. lycopersici race 3 was first observed at that location. These and other isolates of F. oxysporum f. sp. lycopersici were characterized by pathogenicity, race, and vegetative compatibility group (VCG). Of the 39 California isola...

full text

Developing of Dna-marker to the Fusarium Oxysporum F. Sp. Lycopersici Resistance Genes of Tomato

Fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici is a destructive disease of tomato crops worldwide. The use of resistant varieties is the best strategy for disease control. In the present study we analyze eight tomato lines and hybrids for Fusarium wilt disease resistance by polymerase chain reaction. Total genomic DNA was extracted from young leaves of three-week-old plants of to...

full text

Interaction between Meloidogyne incognita and Agrobacterium tumefaciens or Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici on Tomato.

Agrobacterium tumefaciens stimulated and Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici inhibited development and reproduction of Meloidogyne incognita when applied to the opposite split root of tomato, Lycopersicon esculentum cv. Tropic, plants. The lowest rate of nematode reproduction occurred after 2,000 juveniles were applied and the fungus was present in the opposite split root. The effects of all ...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}

Journal title:

یافته های نوین در علوم زیستی

جلد ۲، شماره ۴، صفحات ۲۳۵-۲۴۹

Keywords

پروتئین ترشحی برهم کنش مولکولی گیاه و بیمارگر بیماری پژمردگی آوندی

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com